Høyere startkostnader: Sammenlignet med tradisjonelle solcellepaneler på taket, har solcelletakstein ofte høyere investeringskostnader.
Litt lavere energieffektivitet: Vanligvis kan energikonverteringseffektiviteten til solcelletakstein være litt lavere enn for standard solcellemoduler.
Mangel på installasjonstjenester: For tiden er det relativt få selskaper som tilbyr installasjonstjenester for solcelletakstein, noe som kan forårsake noen ulemper under installasjonsprosessen.